二者认证对象不同：OCS认证的对象是用认可的有机原料生产的使用非食品产品。而GOTS认证仅限于用有机天然纤维生产的纺织品。
原料要求不同：OCS含有5%以上的符合被认可的有机标准的原料,而GOTS认证要求更严格些，要求含有70%的有机天然纤维，不允许混纺，最多含有10%的合成或再生纤维(运动用品可以最多含有25%的合成或再生纤维)，不用转基因纤维。
GOTS标准认证的目的是确保有机纺织品从收获、到原材料、到加工以及到最后产品包装的规范性，以便给最终的消费者带来可信赖的产品。这个新行的、独特的认证法规要求纺织品制造商以全球公认的标准来规范他们的有机纺织品和服装的生产，这是实现纺织品标签协调化和透明化的一个重要措施。
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